Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Polr3kQ9CQZ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Polr3kQ9CQZ7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Polr3kQ9CQZ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms