Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab5aQ9CQD1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rab5aQ9CQD1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rab5aQ9CQD1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms