Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
StambpQ9CQ26 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
StambpQ9CQ26 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
StambpQ9CQ26 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
StambpQ9CQ26 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms