Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnaseh2cQ9CQ18 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnaseh2cQ9CQ18 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms