Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930519G04RikQ9CPT7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930519G04RikQ9CPT7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930519G04RikQ9CPT7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms