Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gdpd3Q99LY2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gdpd3Q99LY2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gdpd3Q99LY2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gdpd3Q99LY2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms