Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk5rap3Q99LM2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap3Q99LM2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap3Q99LM2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms