Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lactb2Q99KR3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lactb2Q99KR3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lactb2Q99KR3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lactb2Q99KR3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms