Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp11Q99K46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp11Q99K46 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp11Q99K46 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp11Q99K46 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms