Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EpcamQ99JW5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EpcamQ99JW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EpcamQ99JW5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EpcamQ99JW5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms