Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PdgfdQ925I7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PdgfdQ925I7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PdgfdQ925I7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PdgfdQ925I7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PdgfdQ925I7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms