Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPDL3BQ92485 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMPDL3BQ92485 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SMPDL3BQ92485 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPDL3BQ92485 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms