Protein–RNA interactions for Protein: Q91VZ6

Smap1, Stromal membrane-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap1Q91VZ6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smap1Q91VZ6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smap1Q91VZ6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smap1Q91VZ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smap1Q91VZ6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smap1Q91VZ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms