Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHK1

Caskin2, Caskin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin2Q8VHK1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Caskin2Q8VHK1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Caskin2Q8VHK1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Caskin2Q8VHK1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caskin2Q8VHK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caskin2Q8VHK1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caskin2Q8VHK1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Caskin2Q8VHK1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms