Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE01

Dusp18, Dual specificity protein phosphatase 18, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp18Q8VE01 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dusp18Q8VE01 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dusp18Q8VE01 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dusp18Q8VE01 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dusp18Q8VE01 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms