Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV3

Rab3il1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3il1Q8VDV3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rab3il1Q8VDV3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rab3il1Q8VDV3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rab3il1Q8VDV3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab3il1Q8VDV3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.3 ms