Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc28Q8VCE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnajc28Q8VCE1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc28Q8VCE1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc28Q8VCE1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc28Q8VCE1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms