Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc9Q8VC31 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc9Q8VC31 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc9Q8VC31 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc9Q8VC31 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms