Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms