Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbm17Q8JZX4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbm17Q8JZX4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbm17Q8JZX4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbm17Q8JZX4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbm17Q8JZX4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rbm17Q8JZX4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rbm17Q8JZX4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm17Q8JZX4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms