Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SbsnQ8CIT9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SbsnQ8CIT9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SbsnQ8CIT9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SbsnQ8CIT9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.8 ms