Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nrip1Q8CBD1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nrip1Q8CBD1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrip1Q8CBD1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrip1Q8CBD1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrip1Q8CBD1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms