Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Parp9Q8CAS9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Parp9Q8CAS9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Parp9Q8CAS9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Parp9Q8CAS9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms