Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc159Q8C963 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc159Q8C963 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc159Q8C963 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc159Q8C963 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc159Q8C963 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc159Q8C963 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc159Q8C963 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc159Q8C963 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms