Protein–RNA interactions for Protein: Q8C176

Taf2, Transcription initiation factor TFIID subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf2Q8C176 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Taf2Q8C176 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Taf2Q8C176 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf2Q8C176 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf2Q8C176 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf2Q8C176 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf2Q8C176 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf2Q8C176 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf2Q8C176 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf2Q8C176 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms