Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUP8

Fam43a, Protein FAM43A, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43aQ8BUP8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fam43aQ8BUP8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fam43aQ8BUP8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam43aQ8BUP8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam43aQ8BUP8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam43aQ8BUP8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam43aQ8BUP8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam43aQ8BUP8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam43aQ8BUP8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms