Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMA6

Srp68, Signal recognition particle subunit SRP68, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp68Q8BMA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srp68Q8BMA6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srp68Q8BMA6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srp68Q8BMA6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srp68Q8BMA6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srp68Q8BMA6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Srp68Q8BMA6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srp68Q8BMA6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Srp68Q8BMA6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Srp68Q8BMA6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms