Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc38a9Q8BGD6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc38a9Q8BGD6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc38a9Q8BGD6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc38a9Q8BGD6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc38a9Q8BGD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms