Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pknox2Q8BG99 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pknox2Q8BG99 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pknox2Q8BG99 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pknox2Q8BG99 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.1 ms