Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG51

Rhot1, Mitochondrial Rho GTPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhot1Q8BG51 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhot1Q8BG51 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhot1Q8BG51 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhot1Q8BG51 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rhot1Q8BG51 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms