Protein–RNA interactions for Protein: Q80X53

Ccdc116, Coiled-coil domain-containing protein 116, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc116Q80X53 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc116Q80X53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc116Q80X53 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc116Q80X53 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms