Protein–RNA interactions for Protein: Q80WV7

Srrm3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm3Q80WV7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Srrm3Q80WV7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Srrm3Q80WV7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srrm3Q80WV7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srrm3Q80WV7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srrm3Q80WV7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms