Protein–RNA interactions for Protein: Q80TR4

Slit1, Slit homolog 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit1Q80TR4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29,46■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Slit1Q80TR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Slit1Q80TR4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Slit1Q80TR4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29,31■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29,3■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Slit1Q80TR4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Slit1Q80TR4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Slit1Q80TR4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Slit1Q80TR4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Slit1Q80TR4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,7 ms