Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pdcl2Q78Y63 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pdcl2Q78Y63 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pdcl2Q78Y63 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pdcl2Q78Y63 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms