Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Chsy1Q6ZQ11 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chsy1Q6ZQ11 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chsy1Q6ZQ11 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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