Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Zc3h4Q6ZPZ3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Zc3h4Q6ZPZ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms