Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tfap2eQ6VUP9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tfap2eQ6VUP9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tfap2eQ6VUP9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tfap2eQ6VUP9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms