Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NfrkbQ6PIJ4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NfrkbQ6PIJ4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NfrkbQ6PIJ4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NfrkbQ6PIJ4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms