Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc82Q6PG04 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc82Q6PG04 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc82Q6PG04 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc82Q6PG04 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc82Q6PG04 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms