Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB51

Ccdc117, Coiled-coil domain-containing protein 117, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc117Q6PB51 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc117Q6PB51 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc117Q6PB51 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc117Q6PB51 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc117Q6PB51 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms