Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8W9

Hmgb4, High mobility group protein B4, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb4Q6P8W9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hmgb4Q6P8W9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hmgb4Q6P8W9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hmgb4Q6P8W9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hmgb4Q6P8W9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hmgb4Q6P8W9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms