Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krba1Q6NXZ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krba1Q6NXZ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krba1Q6NXZ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krba1Q6NXZ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms