Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU2

Klhl23, Kelch-like protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl23Q6GQU2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl23Q6GQU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl23Q6GQU2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl23Q6GQU2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhl23Q6GQU2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhl23Q6GQU2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Klhl23Q6GQU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klhl23Q6GQU2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms