Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q6GQU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6GQU0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q6GQU0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6GQU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q6GQU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q6GQU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6GQU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6GQU0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q6GQU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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