Protein–RNA interactions for Protein: Q64318

Zeb1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb1Q64318 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Zeb1Q64318 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Zeb1Q64318 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Zeb1Q64318 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Zeb1Q64318 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Zeb1Q64318 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Zeb1Q64318 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms