Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Arl13bQ640N2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arl13bQ640N2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Arl13bQ640N2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Arl13bQ640N2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms