Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik1Q60934 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik1Q60934 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik1Q60934 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik1Q60934 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms