Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE0

Mybpc2, Myosin-binding protein C, fast-type, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mybpc2Q5XKE0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mybpc2Q5XKE0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mybpc2Q5XKE0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Mybpc2Q5XKE0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Mybpc2Q5XKE0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mybpc2Q5XKE0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mybpc2Q5XKE0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Mybpc2Q5XKE0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mybpc2Q5XKE0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mybpc2Q5XKE0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mybpc2Q5XKE0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mybpc2Q5XKE0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms