Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5730522E02RikQ5SP45 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
5730522E02RikQ5SP45 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
5730522E02RikQ5SP45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
5730522E02RikQ5SP45 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms