Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rassf5Q5EBH1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rassf5Q5EBH1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf5Q5EBH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf5Q5EBH1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms